MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 38476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	CG	4	8	223	230	0 %	0 %	50 %	50 %	384194623
2	NC_017217	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	384194623
3	NC_017217	GGT	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194623
4	NC_017217	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194623
5	NC_017217	GC	3	6	351	356	0 %	0 %	50 %	50 %	384194623
6	NC_017217	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
7	NC_017217	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194623
8	NC_017217	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
9	NC_017217	GCG	3	9	563	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194623
10	NC_017217	CGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
11	NC_017217	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
12	NC_017217	ACG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
13	NC_017217	CAC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194623
14	NC_017217	CGC	2	6	771	776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
15	NC_017217	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	384194623
16	NC_017217	CGG	2	6	961	966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194623
17	NC_017217	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	384194623
18	NC_017217	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	384194623
19	NC_017217	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	384194623
20	NC_017217	TGC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194623
21	NC_017217	CGA	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
22	NC_017217	CGG	2	6	1192	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194623
23	NC_017217	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194623
24	NC_017217	GCC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
25	NC_017217	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194623
26	NC_017217	GCC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
27	NC_017217	ACG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
28	NC_017217	CAA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194623
29	NC_017217	CT	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	384194623
30	NC_017217	ACC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194623
31	NC_017217	CAC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194623
32	NC_017217	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194623
33	NC_017217	CG	4	8	1609	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	384194623
34	NC_017217	CGA	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
35	NC_017217	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194623
36	NC_017217	CG	3	6	1710	1715	0 %	0 %	50 %	50 %	384194623
37	NC_017217	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194623
38	NC_017217	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	384194623
39	NC_017217	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	384194623
40	NC_017217	AGC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194623
41	NC_017217	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	384194624
42	NC_017217	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194624
43	NC_017217	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	384194624
44	NC_017217	GGC	2	6	2596	2601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194624
45	NC_017217	CG	4	8	2644	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	384194624
46	NC_017217	CGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194624
47	NC_017217	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194624
48	NC_017217	TGC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194624
49	NC_017217	GAC	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194624
50	NC_017217	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	384194624
51	NC_017217	CGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194624
52	NC_017217	GCG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194624
53	NC_017217	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	384194624
54	NC_017217	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194624
55	NC_017217	TGG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194624
56	NC_017217	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	384194624
57	NC_017217	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	384194624
58	NC_017217	GAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194624
59	NC_017217	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194624
60	NC_017217	GAG	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194624
61	NC_017217	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
62	NC_017217	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
63	NC_017217	GCC	2	6	3863	3868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194625
64	NC_017217	CG	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	384194625
65	NC_017217	AGA	2	6	3883	3888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194625
66	NC_017217	ACA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194625
67	NC_017217	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194625
68	NC_017217	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194625
69	NC_017217	TCG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
70	NC_017217	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194625
71	NC_017217	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	384194625
72	NC_017217	GCC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194625
73	NC_017217	CG	3	6	4178	4183	0 %	0 %	50 %	50 %	384194625
74	NC_017217	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194625
75	NC_017217	GAG	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194625
76	NC_017217	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	384194625
77	NC_017217	CGT	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
78	NC_017217	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194625
79	NC_017217	GGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194625
80	NC_017217	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194625
81	NC_017217	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
82	NC_017217	CGCTGG	2	12	4623	4634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384194625
83	NC_017217	TCT	2	6	4657	4662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194625
84	NC_017217	GTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194625
85	NC_017217	CGA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194625
86	NC_017217	CGT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194625
87	NC_017217	ATC	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194625
88	NC_017217	GCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194625
89	NC_017217	GCCCAT	2	12	4823	4834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384194625
90	NC_017217	GGC	2	6	4846	4851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194625
91	NC_017217	GGC	2	6	4871	4876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194625
92	NC_017217	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	384194625
93	NC_017217	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194625
94	NC_017217	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	384194625
95	NC_017217	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	384194625
96	NC_017217	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	384194625
97	NC_017217	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	384194626
98	NC_017217	GAG	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194626
99	NC_017217	CGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194626
100	NC_017217	GTT	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384194626
101	NC_017217	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	384194626
102	NC_017217	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	384194626
103	NC_017217	CGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194626
104	NC_017217	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194626
105	NC_017217	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	384194626
106	NC_017217	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	384194627
107	NC_017217	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	384194627
108	NC_017217	ACG	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
109	NC_017217	GAC	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
110	NC_017217	ACG	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
111	NC_017217	CAC	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194627
112	NC_017217	TCG	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194627
113	NC_017217	CGA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
114	NC_017217	CGA	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
115	NC_017217	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194627
116	NC_017217	CGG	4	12	6208	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194627
117	NC_017217	CGG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194627
118	NC_017217	GGT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194627
119	NC_017217	CG	3	6	6279	6284	0 %	0 %	50 %	50 %	384194627
120	NC_017217	CTA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194627
121	NC_017217	CGA	3	9	6379	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
122	NC_017217	GAC	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
123	NC_017217	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
124	NC_017217	CAG	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
125	NC_017217	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194627
126	NC_017217	GC	3	6	6542	6547	0 %	0 %	50 %	50 %	384194627
127	NC_017217	CGGCGA	2	12	6559	6570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384194627
128	NC_017217	GGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194627
129	NC_017217	CCA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194627
130	NC_017217	GGC	2	6	6803	6808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194627
131	NC_017217	GAG	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194627
132	NC_017217	CG	3	6	6827	6832	0 %	0 %	50 %	50 %	384194627
133	NC_017217	CAAAGA	2	12	6880	6891	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384194627
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258	NC_017217	CGA	2	6	11378	11383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194629
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261	NC_017217	ACC	2	6	11655	11660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194630
262	NC_017217	CGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194630
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264	NC_017217	TGC	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194630
265	NC_017217	TGA	2	6	11853	11858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194630
266	NC_017217	CGT	2	6	11860	11865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194630
267	NC_017217	GCT	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194630
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274	NC_017217	TTC	2	6	12470	12475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194630
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278	NC_017217	GCT	2	6	12535	12540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194630
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380	NC_017217	GAC	2	6	17310	17315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194635
381	NC_017217	TGGC	2	8	17348	17355	0 %	25 %	50 %	25 %	384194635
382	NC_017217	CAA	2	6	17393	17398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194635
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384	NC_017217	GGA	2	6	17519	17524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194635
385	NC_017217	GATC	2	8	17549	17556	25 %	25 %	25 %	25 %	384194635
386	NC_017217	GGA	2	6	17591	17596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194635
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497	NC_017217	GC	4	8	25214	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	384194642
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